Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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