Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q3U6N9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Q3U6N9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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