Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms