Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usp39Q3TIX9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usp39Q3TIX9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usp39Q3TIX9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usp39Q3TIX9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usp39Q3TIX9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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