Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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