Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms