Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms