Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MestQ07646 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MestQ07646 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms