Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms