Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms