Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms