Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VcpQ01853 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VcpQ01853 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcpQ01853 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms