Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms