Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcc1P97496 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms