Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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