Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms