Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn1P70268 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkn1P70268 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms