Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NfixP70257 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NfixP70257 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfixP70257 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfixP70257 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms