Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d1P61080 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms