Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NcstnP57716 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms