Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41l4aP52963 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Epb41l4aP52963 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms