Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ClgnP52194 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ClgnP52194 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms