Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms