Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms