Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2afxP27661 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2afxP27661 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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