Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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