Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChgaP26339 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms