Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkchP23298 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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