Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P20040 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P20040 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms