Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NefhP19246 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms