Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P10404 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P10404 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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