Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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