Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms