Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm3278L7N2D2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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