Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm21719J3KMI9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21719J3KMI9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21719J3KMI9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21719J3KMI9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21719J3KMI9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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