Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XntrpcF8VQM8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms