Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rarres1F6ZIS7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms