Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms