Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc1E9Q043 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc1E9Q043 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms