Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc8E9PWG2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms