Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SafbD3YXK2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SafbD3YXK2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms