Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms