Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms