Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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