Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn3aA2ASI5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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