Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ttll9A2APC3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms