Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms