Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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