Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms