Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms